＜由緒＞

元来は海洋に対する信仰によって創祀されたと考えられ、
古くから青島自体が霊域として崇められており、
そこから後述するように江戸時代まで全島が禁足地とされていた。
社伝によれば、山幸海幸神話で、彦火火出見命が
海神宮（わたつみのみや）から帰還した際に青島に上陸して宮を営んだため、
その宮跡に命と上記2柱の神を祀ったのに始まると伝える
寛文2年（1662年）の大地震で旧記古文書類を失った為に
創祀の古伝を詳らかにしえないという

神社の旧記によれば、平安時代の日向国の国司の巡視記とされる
『日向土産』なる書に「嵯峨天皇の御宇に奉崇（あがめまつる）
青島大明神」と記され当時既に崇敬されていたと伝え、その後文亀3年（1503年）に
伊東尹祐によって再興されて以降、伊東市氏篤い崇敬を受け、
大永3年（1523年）、天正6年（1578年）、貞亮４年（1687年）、
寛保2年（1742年）、明和4年（1767年）、文化5年（1808年）と
6度にわたる社殿の造営・改修や、境内の保全事業が行われた。
また、飫肥藩時代は藩士の中で土器（かわらけ）格の者1人を島奉行に任じ
島内の樹林や磯辺を監守させた他、牛馬を渡島させたり発砲を禁じたりと
一切の汚穢を警戒させていた元文2年（1737年）まで入島は神職と島奉行のみに限られ、
村民は対岸の尖浜（現青島海水浴場）に拝所を設けて遙拝していたが、
当時の神主であった長友肥後が藩主に解禁を申請し、
以来一般人の渡島参詣が可能になった。

明治4年（1871年）村社に列し、戦後は神社本庁の別表神社に指定された。